2019年12月底新型冠狀病毒（簡稱新冠病毒）肺炎疫情暴發(fā)，中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）率先響應(yīng)，成立抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，開展新冠病毒基因組信息整合與變異鑒定注釋等分析工作，于2020年1月22日發(fā)布新冠病毒信息庫2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），為新冠病毒相關(guān)的科學(xué)研究、疫情防控等提供服務(wù)與支撐。這一工作被寫入國務(wù)院新聞辦公室發(fā)布的《抗擊新冠肺炎疫情的中國行動(dòng)》白皮書。 第一版數(shù)據(jù)庫發(fā)布之后（相關(guān)文章于2020年2月12日在《遺傳》雜志中文版發(fā)表），抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)不斷優(yōu)化改進(jìn)變異監(jiān)測與演化分析方法，豐富完善數(shù)據(jù)庫功能。2020年12月28日，國際學(xué)術(shù)期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在線發(fā)表題為“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升級(jí)版文章，系統(tǒng)介紹該數(shù)據(jù)庫自第一版發(fā)布以來的更新情況，包括基因組信息統(tǒng)計(jì)、基因組變異全景、基因組變異時(shí)空動(dòng)態(tài)、單倍型網(wǎng)絡(luò)演化四個(gè)主要方面。 2019nCoVR收集整合國內(nèi)外多個(gè)數(shù)據(jù)庫公開的新冠病毒基因組數(shù)據(jù)，提供實(shí)時(shí)、全面的新冠病毒基因組元信息、數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估、全球分布與統(tǒng)計(jì)等，通過人工審編和自動(dòng)化質(zhì)量評(píng)估，補(bǔ)充增值注釋信息。在此基礎(chǔ)上，2019nCoVR分析高質(zhì)量的全長人源病毒基因組數(shù)據(jù)，注釋新冠病毒基因組變異，獲得全球范圍內(nèi)新冠病毒基因組變異圖譜，基于采樣時(shí)間和國家進(jìn)行變異動(dòng)態(tài)展示并構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)，監(jiān)測新冠病毒的時(shí)空傳播。截至2021年1月4日，2019nCoVR數(shù)據(jù)庫已為全球175個(gè)國家／地區(qū)的近20萬用戶提供數(shù)據(jù)服務(wù)，訪問量超50萬次，累計(jì)數(shù)據(jù)下載超過2.2億條，有效支撐了北京新發(fā)地疫情分子溯源、巴基斯坦國內(nèi)新冠病毒傳播演化分析等工作，在全球抗疫過程中發(fā)揮了重要作用。 中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）副研究員宋述慧、馬利娜（兩人均為青年創(chuàng)新促會(huì)會(huì)員）等為該文共同第一作者，鮑一明研究員、薛勇彪研究員、趙文明正高級(jí)工程師、章張研究員為該文共同通訊作者。宋述慧副研究員長期從事基因組序列變異分析及遺傳變異與表型關(guān)聯(lián)知識(shí)的挖掘應(yīng)用等研究，在該工作中主要負(fù)責(zé)新冠病毒基因組序列變異鑒定與注釋、時(shí)空動(dòng)態(tài)監(jiān)測、序列單體型演化等分析與研究。馬利娜副研究員致力于生物大數(shù)據(jù)整合與分析挖掘等研究，在該項(xiàng)目中負(fù)責(zé)全球新冠病毒基因組信息整合、標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)控審編、結(jié)構(gòu)化入庫、基因組注釋等工作。本研究得到了中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、戰(zhàn)略先導(dǎo)專項(xiàng)、信息化專項(xiàng)，以及國家科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目支持。
2019年12月底新型冠狀病毒（簡稱新冠病毒）肺炎疫情暴發(fā)，中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）率先響應(yīng)，成立抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，開展新冠病毒基因組信息整合與變異鑒定注釋等分析工作，于2020年1月22日發(fā)布新冠病毒信息庫2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），為新冠病毒相關(guān)的科學(xué)研究、疫情防控等提供服務(wù)與支撐。這一工作被寫入國務(wù)院新聞辦公室發(fā)布的《抗擊新冠肺炎疫情的中國行動(dòng)》白皮書。 第一版數(shù)據(jù)庫發(fā)布之后（相關(guān)文章于2020年2月12日在《遺傳》雜志中文版發(fā)表），抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)不斷優(yōu)化改進(jìn)變異監(jiān)測與演化分析方法，豐富完善數(shù)據(jù)庫功能。2020年12月28日，國際學(xué)術(shù)期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在線發(fā)表題為“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升級(jí)版文章，系統(tǒng)介紹該數(shù)據(jù)庫自第一版發(fā)布以來的更新情況，包括基因組信息統(tǒng)計(jì)、基因組變異全景、基因組變異時(shí)空動(dòng)態(tài)、單倍型網(wǎng)絡(luò)演化四個(gè)主要方面。 2019nCoVR收集整合國內(nèi)外多個(gè)數(shù)據(jù)庫公開的新冠病毒基因組數(shù)據(jù)，提供實(shí)時(shí)、全面的新冠病毒基因組元信息、數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估、全球分布與統(tǒng)計(jì)等，通過人工審編和自動(dòng)化質(zhì)量評(píng)估，補(bǔ)充增值注釋信息。在此基礎(chǔ)上，2019nCoVR分析高質(zhì)量的全長人源病毒基因組數(shù)據(jù)，注釋新冠病毒基因組變異，獲得全球范圍內(nèi)新冠病毒基因組變異圖譜，基于采樣時(shí)間和國家進(jìn)行變異動(dòng)態(tài)展示并構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)，監(jiān)測新冠病毒的時(shí)空傳播。截至2021年1月4日，2019nCoVR數(shù)據(jù)庫已為全球175個(gè)國家／地區(qū)的近20萬用戶提供數(shù)據(jù)服務(wù)，訪問量超50萬次，累計(jì)數(shù)據(jù)下載超過2.2億條，有效支撐了北京新發(fā)地疫情分子溯源、巴基斯坦國內(nèi)新冠病毒傳播演化分析等工作，在全球抗疫過程中發(fā)揮了重要作用。 中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）副研究員宋述慧、馬利娜（兩人均為青年創(chuàng)新促會(huì)會(huì)員）等為該文共同第一作者，鮑一明研究員、薛勇彪研究員、趙文明正高級(jí)工程師、章張研究員為該文共同通訊作者。宋述慧副研究員長期從事基因組序列變異分析及遺傳變異與表型關(guān)聯(lián)知識(shí)的挖掘應(yīng)用等研究，在該工作中主要負(fù)責(zé)新冠病毒基因組序列變異鑒定與注釋、時(shí)空動(dòng)態(tài)監(jiān)測、序列單體型演化等分析與研究。馬利娜副研究員致力于生物大數(shù)據(jù)整合與分析挖掘等研究，在該項(xiàng)目中負(fù)責(zé)全球新冠病毒基因組信息整合、標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)控審編、結(jié)構(gòu)化入庫、基因組注釋等工作。本研究得到了中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、戰(zhàn)略先導(dǎo)專項(xiàng)、信息化專項(xiàng)，以及國家科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目支持。 2019年12月底新型冠狀病毒（簡稱新冠病毒）肺炎疫情暴發(fā)，中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）率先響應(yīng)，成立抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，開展新冠病毒基因組信息整合與變異鑒定注釋等分析工作，于2020年1月22日發(fā)布新冠病毒信息庫2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），為新冠病毒相關(guān)的科學(xué)研究、疫情防控等提供服務(wù)與支撐。這一工作被寫入國務(wù)院新聞辦公室發(fā)布的《抗擊新冠肺炎疫情的中國行動(dòng)》白皮書。 第一版數(shù)據(jù)庫發(fā)布之后（相關(guān)文章于2020年2月12日在《遺傳》雜志中文版發(fā)表），抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)不斷優(yōu)化改進(jìn)變異監(jiān)測與演化分析方法，豐富完善數(shù)據(jù)庫功能。2020年12月28日，國際學(xué)術(shù)期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在線發(fā)表題為“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升級(jí)版文章，系統(tǒng)介紹該數(shù)據(jù)庫自第一版發(fā)布以來的更新情況，包括基因組信息統(tǒng)計(jì)、基因組變異全景、基因組變異時(shí)空動(dòng)態(tài)、單倍型網(wǎng)絡(luò)演化四個(gè)主要方面。 2019nCoVR收集整合國內(nèi)外多個(gè)數(shù)據(jù)庫公開的新冠病毒基因組數(shù)據(jù)，提供實(shí)時(shí)、全面的新冠病毒基因組元信息、數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估、全球分布與統(tǒng)計(jì)等，通過人工審編和自動(dòng)化質(zhì)量評(píng)估，補(bǔ)充增值注釋信息。在此基礎(chǔ)上，2019nCoVR分析高質(zhì)量的全長人源病毒基因組數(shù)據(jù)，注釋新冠病毒基因組變異，獲得全球范圍內(nèi)新冠病毒基因組變異圖譜，基于采樣時(shí)間和國家進(jìn)行變異動(dòng)態(tài)展示并構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)，監(jiān)測新冠病毒的時(shí)空傳播。截至2021年1月4日，2019nCoVR數(shù)據(jù)庫已為全球175個(gè)國家／地區(qū)的近20萬用戶提供數(shù)據(jù)服務(wù)，訪問量超50萬次，累計(jì)數(shù)據(jù)下載超過2.2億條，有效支撐了北京新發(fā)地疫情分子溯源、巴基斯坦國內(nèi)新冠病毒傳播演化分析等工作，在全球抗疫過程中發(fā)揮了重要作用。 中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）副研究員宋述慧、馬利娜（兩人均為青年創(chuàng)新促會(huì)會(huì)員）等為該文共同第一作者，鮑一明研究員、薛勇彪研究員、趙文明正高級(jí)工程師、章張研究員為該文共同通訊作者。宋述慧副研究員長期從事基因組序列變異分析及遺傳變異與表型關(guān)聯(lián)知識(shí)的挖掘應(yīng)用等研究，在該工作中主要負(fù)責(zé)新冠病毒基因組序列變異鑒定與注釋、時(shí)空動(dòng)態(tài)監(jiān)測、序列單體型演化等分析與研究。馬利娜副研究員致力于生物大數(shù)據(jù)整合與分析挖掘等研究，在該項(xiàng)目中負(fù)責(zé)全球新冠病毒基因組信息整合、標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)控審編、結(jié)構(gòu)化入庫、基因組注釋等工作。本研究得到了中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、戰(zhàn)略先導(dǎo)專項(xiàng)、信息化專項(xiàng)，以及國家科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目支持。 2019年12月底新型冠狀病毒（簡稱新冠病毒）肺炎疫情暴發(fā)，中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）率先響應(yīng)，成立抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，開展新冠病毒基因組信息整合與變異鑒定注釋等分析工作，于2020年1月22日發(fā)布新冠病毒信息庫2019nCoVR（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），為新冠病毒相關(guān)的科學(xué)研究、疫情防控等提供服務(wù)與支撐。這一工作被寫入國務(wù)院新聞辦公室發(fā)布的《抗擊新冠肺炎疫情的中國行動(dòng)》白皮書。 第一版數(shù)據(jù)庫發(fā)布之后（相關(guān)文章于2020年2月12日在《遺傳》雜志中文版發(fā)表），抗疫攻關(guān)團(tuán)隊(duì)不斷優(yōu)化改進(jìn)變異監(jiān)測與演化分析方法，豐富完善數(shù)據(jù)庫功能。2020年12月28日，國際學(xué)術(shù)期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在線發(fā)表題為“The Global Landscape of SARS-CoV-2 Genomes, Variants, and Haplotypes in 2019nCoVR”的2019nCoVR升級(jí)版文章，系統(tǒng)介紹該數(shù)據(jù)庫自第一版發(fā)布以來的更新情況，包括基因組信息統(tǒng)計(jì)、基因組變異全景、基因組變異時(shí)空動(dòng)態(tài)、單倍型網(wǎng)絡(luò)演化四個(gè)主要方面。 2019nCoVR收集整合國內(nèi)外多個(gè)數(shù)據(jù)庫公開的新冠病毒基因組數(shù)據(jù)，提供實(shí)時(shí)、全面的新冠病毒基因組元信息、數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估、全球分布與統(tǒng)計(jì)等，通過人工審編和自動(dòng)化質(zhì)量評(píng)估，補(bǔ)充增值注釋信息。在此基礎(chǔ)上，2019nCoVR分析高質(zhì)量的全長人源病毒基因組數(shù)據(jù)，注釋新冠病毒基因組變異，獲得全球范圍內(nèi)新冠病毒基因組變異圖譜，基于采樣時(shí)間和國家進(jìn)行變異動(dòng)態(tài)展示并構(gòu)建單倍型網(wǎng)絡(luò)，監(jiān)測新冠病毒的時(shí)空傳播。截至2021年1月4日，2019nCoVR數(shù)據(jù)庫已為全球175個(gè)國家／地區(qū)的近20萬用戶提供數(shù)據(jù)服務(wù)，訪問量超50萬次，累計(jì)數(shù)據(jù)下載超過2.2億條，有效支撐了北京新發(fā)地疫情分子溯源、巴基斯坦國內(nèi)新冠病毒傳播演化分析等工作，在全球抗疫過程中發(fā)揮了重要作用。 中國科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）副研究員宋述慧、馬利娜（兩人均為青年創(chuàng)新促會(huì)會(huì)員）等為該文共同第一作者，鮑一明研究員、薛勇彪研究員、趙文明正高級(jí)工程師、章張研究員為該文共同通訊作者。宋述慧副研究員長期從事基因組序列變異分析及遺傳變異與表型關(guān)聯(lián)知識(shí)的挖掘應(yīng)用等研究，在該工作中主要負(fù)責(zé)新冠病毒基因組序列變異鑒定與注釋、時(shí)空動(dòng)態(tài)監(jiān)測、序列單體型演化等分析與研究。馬利娜副研究員致力于生物大數(shù)據(jù)整合與分析挖掘等研究，在該項(xiàng)目中負(fù)責(zé)全球新冠病毒基因組信息整合、標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)控審編、結(jié)構(gòu)化入庫、基因組注釋等工作。本研究得到了中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、戰(zhàn)略先導(dǎo)專項(xiàng)、信息化專項(xiàng)，以及國家科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目支持。
 
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